Python入门到底有多简单（一）：数据读写与输出

发稿时间：2020-08-26来源：天昊生物

很多人觉得数据分析入门很难，但随着B站和公众号上的学习资源越来越多，学习数据分析已经变得非常简单。以下面为例，从一张规则的表格中，根据门水平名称，生成对物种门水平的表格文件。

In [1]:

import pandas as pd

读取文本文件pd.read_table，读取excel文件，

可以用df = pd.read_excel('*.xlsx',sheet_name='*')。

In [2]:

df = pd.read_table('subsample_otu.tax.0.03.xls')

如下图所示，门水平有12个门的数据。

In [3]:

df['phylum'].unique()

Out[3]:

array(['Acidobacteria', 'Actinobacteria', 'Armatimonadetes',
       'Bacteroidetes', 'Chloroflexi', 'Firmicutes', 'Fusobacteria',
       'Gemmatimonadetes', 'Planctomycetes', 'Proteobacteria',
       'Spirochaetes', 'Synergistetes'], dtype=object)

根据门水平名称，提取对应门水平的信息，并生成以门水平名称命名的Excel文件。

In [4]:

for i in df['phylum'].unique():
    df[df['phylum']==i].to_excel(i+".xls",index=False)

Out[4]:

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作者：大熊

审核：有才

来源：天昊生信团