【昊工具】TCGA肿瘤数据库表达-甲基化联合挖掘神器又来了

发稿时间：2019-05-27来源：天昊生物

TCGA肿瘤数据库的挖掘工具不断推陈出新，最近小编又发现一个神器，好用又不失严谨和规范，快和小编一起来了解下吧！

数据库名称：Wanderer

数据库网址：http://maplab.imppc.org/wanderer/

数据库介绍：Wanderer是一个以基因为中心的交互式 web 查看器，可用于检索基因在TCGA数据库不同肿瘤类型中的DNA 甲基化和基因表达情况 （图片可下载，可用于发表）。

参考文章：Díez-Villanueva, Anna, Mallona I , Peinado M A . Wanderer, an interactive viewer to explore DNA methylation and gene expression data in human cancer[J]. Epigenetics & Chromatin, 2015, 8(1):22.

示例：检索PTEN基因在BRCA肿瘤中的甲基化和表达情况 （基因区域共65个甲基化探针）

• 不同位置探针甲基化水平的可视化

• 甲基化和表达量相关性的可视化

•  甲基化和基因表达按统一模式呈现（图片来源于文章）