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如何免费快速不用编程做基因功能富集分析呢? 又有新答案了

发稿时间:2017-12-06来源:天昊生物

2016年5月4号,小编给大家推荐过DAVID在线软件(  网址:https://david.ncifcrf.gov/tools.jsp),用来做一个基因list的通路富集分析。


但是DAVID的更新实在太慢了,这种”物质基础”哪能跟得上我们日益增长的”精神需求”呢!


今天小编给大家推荐另一个免费,快速又好用的基因富集分析网站Metascape,这个网站不仅好用,slogan也很赞: We commit to keep it fresh! (这简直是对DAVID的赤裸裸的嘲讽和挑战啊!)


以下开始正经内容

                                          Metascape网站:http://metascape.org


Metascape网站主页

 


  •  STEP1 : 贴入基因列表或上传基因列表文件 (小编贴入一个基因列表为例)


 


  •  STEP2:选定物种


 


  • STEP3: 点击Expressanalysis。 Customanalysis点击可以进行一些分析参数的设置和修改,比如选择哪些数据库等等。



此处来个下午茶!


分析完成,出报告。报告有网页版,EXCEL版,还有PPT版. 这堪称基因富集分析网站”海底捞“一般的服务水准!图片也可以直接下载用于发表哦~

 

下面请欣赏PPT版分析报告,结果有点美丽:

 

1、首页(备注里还有分析的详细解释哦)

2、基因数目统计


 

3、富集分析总体结果展示 (具体展示内容可以在Customanalysis修改,本图也有对应的表格)

 

4、Cytoscape分析

 

5、 PPI分析


 


小编用起来,

心情那是十分愉悦呢!

各位老师快自己试试看吧~~


更多教程,可以去主页右上角下载使用说明。人家的使用说明写的也是很有趣呢!不信你看这一页:把DAVID died用红圈圈重点突出,就怕大家看不到~~

 

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