副标题:四管齐下:宏基因组+代谢组+粪菌移植+扩增子测序!
英文题目:Gut microbiota dysbiosis contributes to the development of hypertension
中文题目:肠道菌群失调导致高血压的发生
期刊名:Microbiome 发表时间: 2017 影响因子: 8.496
发表单位:中国医学科学院阜外医院高血压中心
技术:
l 宏基因组测序(GM) :41名对照者(Control)、56例高血压前期患者(pHTN)、99例原发性高血压患者(HTN)的粪便样本
l 代谢组(LC/MS):30名对照者(Control)、31例高血压前期患者(pHTN)、63例原发性高血压患者(HTN)的空腹全血样本
l 粪便移植无菌小鼠: 对照组小鼠n=5、HTN组小鼠n=10
l 受体小鼠粪便16S rRNA扩增子测序(V4)
筛选标准:所有高血压患者都是最新诊断的高血压患者,并且都没进行过降压治疗。有癌症、心力衰竭、肾衰竭、吸烟、中风、外周动脉疾病和慢性炎症性疾病的患者被排除。不能使用以下药物,包括他汀类药物、阿司匹林、胰岛素、二甲双胍、硝苯地平和美托洛尔。过去8周内不能接受抗生素或益生菌治疗。除了收缩压和舒张压外,其它临床参数在患者和对照者之间均无显著性差异(除了空腹血糖水平有差异)。
研究背景:
最近,肠道微生物在代谢性疾病中的作用已经显露出来,尤其是在心血管疾病。高血压是世界范围内最常见的心血管疾病之一,然而肠道菌群失调是否参与高血压的发生发展仍然是未知的。为了探讨这个问题,本文对健康对照者、高血压前期患者、原发性高血压患者进行了全面的宏基因组学和代谢组学分析,并将高血压患者粪便菌群移植到无菌小鼠,观察其是否出现高血压症状。
研究结果:
1、 微生物多样性和肠型分析
稀释性曲线结果表明所测数据量已经足够发现绝大多数基因。对照组新基因速率超过疾病组新基因获取速率,提示高血压前期患者(pHTN)和原发性高血压患者(HTN)的基因丰富相对较低(图1A)。与对照组相比,PHTN和HTN组的基因数量显著性减少(图1B)。在属水平PHTN和HTN组的肠道菌群a多样性显著降低(图1C)。这些结果表明高血压患者肠道菌群减少。
196个样本分可以为两个不同的肠型(图1D):肠型1(Prevotella)和肠型2(Bacteroides). PHTN和HTN组具有更多比例的Prevotella肠型,而健康对照组具有更多比例的Bacteroides肠型(图1F)。
图1. 高血压患者微生物多样性降低,肠型发生转化
2、 与高血压相关的菌属
44个菌属在组间存在差异(图2A)。Prevotella和Klebsiella菌在PHTN和HTN组中显著增加(图2B)。Prevotella起源于口腔和生殖道,牙周病和风湿性关节炎与Prevotella相关。许多传染病认为是Klebsiella造成的。相比之下,Faecalibacterium, Oscillibacter, Roseburia,Bifidobacterium, Coprococcus, Butyrivibrio在健康人群富集(图2B)。Faecalibacterium(柔嫩梭菌)和Roseburia(罗斯氏菌)丰度下降已知与克隆氏氏病和溃疡性结肠炎发生相关,这两种细菌都是丁酸生产的关键菌。这表明Prevotella和Klebsiella菌的过度生长可能在高血压的病理中起重要作用。同时需要注意的是,高血压前期组(PHTN)已经具有与高血压组(HTN)类似的微生物群落。这表明肠道菌群变化可能早于高血压的形成。
图2. 各组间的差异菌属分析
3、 PHTN和HTN组中显著富集的CAG
与对照相比,分别有316和372个CAG在PHTN和HTN组得到富集。对照组中显著富集的CAG主要来自Firmicutes和Roseburia(图3A,B);PHTN组富集的CAG主要来自Enterobacter(肠杆菌,一种与肥胖有关的致病细菌);隶属于Fusobacterium和Klebsiella的CAG在PHTN和HTN组得到富集。
图3. 与对照相比,上调或下调菌类型的相关网络分析。CAG为至少包含50个连锁基因的基因簇。节点的大小表示该CAG的基因数量。节点的颜色代表了它们所属分类。斯皮尔曼相关系数值大于0.8用红色线段连接,0.7-0.8用灰色线段连接。
4、 临床指标与CAG细菌相关性分析
将临床指标包括收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、体重指数(BMI)、空腹血糖(FBG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)和低密度脂蛋白(LDL)与CAG进行Spearman相关分析。结果发现:SBP和DBP可以负调控对照组富集的CAG(例如Firmicutes、Roseburia),可以正调控pHTN和HTN组富集的Prevotella和Desulfovibrio。而TC和TG与pHTN和HTN组富集的Enterobacter呈负相关(图S6)。这些结果表明PHTN和HTN组的细菌群落很相似,这些细菌的集体效应可能与
高血压患者的肠道微生态失调相关。表明PHTN和HTN组的细菌群落很相似,这些细菌的集体效应可能与高血压患者的肠道微生态失调相关。
图S6. 临床指标与CAG丰度相关性分析。正相关用红色表示,负相关用蓝色表示,+: p值<0.01;*: p值<0.05。
5、 PHTN和HTN组菌群功能的改变
健康组和高血压组在肠道菌群基因功能上具有明显差异(图4A)。无论是KEGG modules(图4B)还是碳水化合物活性酶类(图4C),与对照组相比,PHTN和HTN组都有类似的差异,说明PHTN和HTN组肠道菌群功能很类似。39个KEGG modules在PHTN和HTN组减少,主要包括:支链氨基酸的合成运输、酮体生物合成、双组分调节系统、甲硫氨酸和嘌呤降解(图4B),这些代谢功能对宿主是必不可少的。17个KEGG modules在PHTN和HTN组升高,主要包括:LPS合成运输、磷脂运输、磷酸转移酶系统(PTS)、
苯丙氨酸和磷脂酰乙醇胺合成、分泌系统(图4B)。PHTN和HTN组的纤维素结合结构域相关基因显著富集但是glycan-utilizing enzymes相关基因显著减少(图4C)。
图4 PHTN和HTN组微生物基因功能注释。 A.196个样品KEGG Orthology相对丰度比较。 B.各组间肠道微生物KEGG modules的差异比较。C. 各组间肠道微生物CAZy家族丰度的差异比较。
6、 各组间肠道菌群代谢物比较分析
因为肠道菌群的代谢产物可以进入血液并可以影响宿主的生理机能,利用LC/MS对124个样本的血清进行代谢物分析,进而对肠道菌群和代谢物进行相关性分析。PLS-DA分析能把代谢物在健康组、PHTN和HTN组明显分开(图5A、B),其中PHTN和HTN组的肠道菌群代谢产物非常类似。对照组和PHTN共有167个代谢物有差异,对照组和HTN组共有215个代谢物有差异(图5C)。值得注意的是,PHTN和HTN组的代谢产物变化非常类似,这与前面的肠道菌群变化紧密相关(图5D)。3,4,5-三甲氧基肉桂酸、溶血磷脂酰胆碱(LysoPC)、S-羧甲基-L-半胱氨酸和溶血磷脂酰乙醇胺(LysoPE)在PHTN和HTN组明显减少。N-乙酰- L -精氨酸α、硬脂酸、磷脂酸(PA)和葡萄糖苷在在PHTN和HTN组明显增多。微生物菌群与代谢产物有相关性:对照组富集的三氯葡萄糖醛酸与Bifidobacterium、Akkermansia正相关,但是与Prevotella呈负相关。HTN组富集的Klebsiella、Prevotella、 Enterbacter与硬脂酸呈正相关,而硬脂酸与Bifidobacterium、Roseburia呈负相关。
图5 PHTN和HTN组的异常代谢模式。 A.不同组别血清代谢谱的PLS-DA分析。 B. 不同组别血清代谢谱的散点图分析。 C. 在PHTN和HTN组发生明显变化的代谢物。ES +:离子模式,ES−:负离子模式。D.不同组别血清代谢产物的差异比较。E. 26种内源性代谢物与44个菌属的Spearman相关性分析。对照组:绿色,高血压组:粉红色。
7、 建立识别高血压病人的的诊断模型
建立了基于CAG和代谢物的高血压疾病诊断模型,此诊断模型可以准确区分高血压患者和健康人,AUC值分别为0.91,表明此模型很准确(图6A),另外此诊断模型也可以准确区分高血压前期患者和健康人,AUC值分别为0.89(图6B)。此模型不能有效区分PHTN和HTN组(图6C)。PHTN和HTN组区别与对照组的一些CAG是共同的:例如CAG-172 (Prevotella), CAG-197(Prevotella), CAG-759 (Faecalibacterium), CAG-765(Faecalibacterium), and CAG-793 (Faecalibacterium) (图6D、E)
图6 建立了从对照组准确区分高血压前期和高血压患者的疾病分类器
8、 粪便移植可以导致血压升高
在这项研究中,似乎高血压的主要原因是肠道微生态失调,因此,本文想研究是否可以通过微生物移植来改变血压。因此把高血压患者的粪便移植到无菌小鼠体内,来看看这些无菌小鼠的反应。本研究的微生物移植供体包括两例高血压患者和正常血压对照者。8~10周的小鼠分为两组(对照组n=5, HTN组n=10 ),分别口服接种供体粪便样本(图7A)。喂养7天后使用通过16S扩增子测序研究受体小鼠的粪便样品。从高血压患者成功定植到无菌小鼠128个菌属。从健康对照者成功定植到无菌小鼠110个菌属(图7B)。香浓指数表明HTN组小鼠细菌多样性少(图7C)。PCoA分析表明高血压患者和对应受体小鼠菌群结构类似,而对照健康人和对应受体小鼠的菌群结构类似(图7D)。属水平上,Anaerotruncus, Coprococcus, Ruminococcus, Clostridium, Roseburia, Blautia, Bifidobasterium在HTN组小鼠较少(图7E),而Coprobacillus和Prevotella则在HTN组小鼠富集,这与前面的人宏基因组分析结果一致。移植后10周,与对照组相比,移植了HTN粪便的小鼠表现出显著较高的收缩压(SBP),舒张压(DBP)和平均血压(MBP)(图7F)。
图7粪便移植后的受体小鼠肠道微生物分布及血压统计。
总结:
l 与健康对照者相比,PHTN和HTN组的微生物丰富度和多样性显著下降。
l PHTN和HTN组具有更多比例的Prevotella肠型。
l PHTN和HTN组中有益菌明显降低、Prevotella和Klebsiella等有害菌过度生长。
l PHTN和HTN组中与疾病相关的微生物功能和基因显著富集。
l PHTN和HTN组的微生物和代谢产物变化非常相似,表明PHTN和HTN组的代谢产物改变与微生物组的改变密切相关。
l 建立了基于菌群和代谢物的疾病诊断模型,能准确区分对照组和高血压前期、高血压患者。
l 将高血压患者粪便移植到无菌小鼠,结果无菌小鼠血压升高。