[昊阅读]6月最新医学微生物群落研究文章精粹

发稿时间：2017-06-21来源：天昊生物

案例1   宫内避孕对生殖道菌群的影响

 

英文题目：Effects of intrauterine contraception on the vaginal microbiota

发表杂志：Contraception

发表时间：2017年6月

影响因子：3

研究目的：确定宫内避孕是否改变生殖道菌群，并且比较宫内节育器(Cu-IUD)和左炔诺孕酮宫内缓释系统(LNG-IUS)对生殖道菌群的影响

研究对象：在宫内避孕前收集36名使用宫内节育器(Cu-IUD)和40名使用左炔诺孕酮宫内缓释系统(LNG-IUS)的生殖道拭子样本；在宫内避孕后6个月收集36名使用宫内节育器(Cu-IUD)和40名使用左炔诺孕酮宫内缓释系统(LNG-IUS)的生殖道拭子样本；在宫内避孕后12个月收集33名使用宫内节育器(Cu-IUD)和36名使用左炔诺孕酮宫内缓释系统(LNG-IUS)的生殖道拭子样本；

技术方法：细菌16S rDNA扩增子测序，V4区

研究结果：

l  生殖道的细菌群落分为3个主要类型：一个以惰性乳酸杆菌为主，一个以卷曲乳杆菌为主，一个不是由单一的乳酸杆菌主导。

l  生殖道细菌群落组成的变化与是否使用Cu-IUD或LNG-IUS不相关，因此使用宫内避孕法不大可能改变生殖道菌群组成，从而改变感染易感性。

l  此外使用Cu-IUD或LNG-IUS的细菌群落组成之间没有明显的差别。

案例2  海兔素对酒精喂养大鼠肠道菌群的影响

 

英文题目：Protective effect of aplysin on liver tissue and the gut microbiota in alcohol-fed rats

发表杂志：Plos one

发表时间：2017年6月

影响因子：2.806

研究目的：研究海兔素对肝脏的保护作用及其对炎症的影响，及酒精性肝损伤大鼠的肠道菌群。

研究对象：雄性Sprague Dawley大鼠：（1）喂养含酒精流质饮食；（2）喂养流质饮食对照组；（3）喂养含海兔素饮食

技术方法：细菌16S rDNA扩增子测序，V3-V4区；肝、肠组织病理学分析；细胞因子水平和肠黏膜屏障评估

研究结果：

l  慢性酒精暴露致大鼠肝损伤。

l  血清谷草转氨酶（AST）、转氨酶（ALT）、碱性磷酸酶（ALP）和甘油三酯（TG）活性均高于对照组。

l  与对照组相比，饮酒导致血清转化生长因子（TGF-β）和肿瘤坏死因子（TNF-α）水平升高，导致白细胞介素-10（IL-10）水平降低。

l  此外，血浆内毒素水平，二胺氧化酶，和脂肪酸结合蛋白2在酒精组均高于对照组。

l  海兔素治疗使乙醇破坏的肠道菌群结构向对照组的肠道菌群结构转化，因此酒精对肠道菌群结构诱导的作用，可被海兔素逆转治疗。

案例3  非埋入式种植体边缘骨丢失与骨愈合过程中的唾液微生物相关

 

英文题目：Marginal bone loss around non-submerged implants is associated with salivary microbiome during bone healing

发表杂志：International Journal of Oral Science

发表时间：2017年6月

影响因子：3.93

研究目的：研究骨愈合过程中不同程度边缘骨丢失和唾液微生物的关系

研究对象：100名患者（50个男性和50个女性；平均年龄：46.78岁；范围：18-60岁；汉族）, 根据边缘骨量丢失的严重程度分为三组:（1）正常组：28个正常个体；（2）中度组：36个中度个体；（3）严重组：36个严重个体；

技术方法：细菌16S rDNA扩增子测序，V4区；

研究结果：

l  螺旋体门和互养菌门的丰度随着骨损失严重程度增加而明显增加。

l  与骨丢失严重组相比，密螺旋体属表现出丰度的增加，而韦荣球菌属、嗜血杆菌属和纤毛菌属表现出丰度的减少。

l  牙龈卟啉单胞菌，齿垢密螺旋体和中间链球菌组在中度组和/或严重组更丰富。

l  非埋入种植体周围骨质丢失的严重程度与不同菌落结构有关，边缘骨丢失的严重程度与牙周致病性物质的比例增加有关。

 

 

案例4  吸毒人群肠道菌群多样性

 

英文题目：Bacterial Diversity of Intestinal Microbiota in Patients with Substance Use Disorders Revealed by 16S rRNA Gene Deep Sequencing

发表杂志：Scientific Reports

发表时间：2017年6月

影响因子：4.259

研究目的：研究吸毒人群肠道菌群多样性

研究对象：45名药物滥用患者(SUDs)和48名健康对照者(HCs)的粪便样本

技术方法：细菌16S rDNA扩增子测序，V3-V4区；

研究结果：

l  相对于健康对照者，所观察到的物种多样性指数、陶厄氏菌属、副球菌属、和普雷沃菌属在药物滥用患者人群中都明显较高。

l  基于物种的功能分析表明，包括翻译、DNA复制和修复、细胞生长和死亡等途径在药物滥用患者人群中都明显富集，而细胞信号、代谢等途径在健康人群中明显富集。

 

 

 

关于天昊：

      天昊生物采用Miseq PE250测序策略对细菌16S rDNA区/真菌ITS区/真菌18S rDNA区的双V区或多种单V区进行测序，使用低循环数扩增，保证每个样品扩增的循环数统一；采用特殊方法可有效避免系统内误差；数据质量高，有效序列Q30达到80%以上；加上最新升级的分析内容和解释详尽的结题报告，带您享受极致的微生物扩增子测序体验。