“工匠精神”不能停--2016天昊生物医学基因组测序文章集锦

发稿时间：2017-01-13来源：天昊生物

感言

每个行业都需要“匠心”，这种精神代表了对自己所从事事业的全身心投入，对自己的产品/服务精雕细琢，精益求精、追求更完美的精神理念。天昊从2008年成立以来，追求的就是这种简单却执着的精神，力求为中国的科研工作者提供最专业的科研服务

回顾与期待

回顾2016，这种“匠心”协助我们的客户发表了127篇文章，累计影响因子400+。对于医学基因组测序方向，更是高分文章云集，累计影响因子90+，涉及到了全外显子测序和富有天昊特色的多种目的区域测序技术平台。“匠心”除了坚持，更依赖于创新与特色。独具天昊特色的多种通量目的区域测序平台，受到了很多科研工作者的认可，目前已经成功完成了近90个大样品量目的区域富集测序项目，样本总量超过43000例，预示着2017年一大波好文章来袭！敬请期待~

接下来，就让我们一起回顾一些医学基因组方向的重点文章，期待2017年更多的收获！

全外显子测序文章

o    胆汁淤积性肝病是儿童期发展至肝硬化失代偿，并需要肝移植的主要原因。遗传性胆汁淤积症致病基因数量众多，目前仍有很多患者不能明确诊断，提示可能存在其它尚未发现的新致病基因。

o     本研究中，研究者首先应用筛查63种已知遗传性胆汁淤积症致病基因靶向测序panel，精选了24例临床表现为不明原因低GGT胆汁淤积的核心家系，进行全外显子组测序：测序结果中，有5个病例存在MYO5B基因的纯合、复合杂合突变。进一步的统计学分析、肝组织免疫组化以及血浆胆汁酸谱分析表明，MYO5B突变与低GGT（血清γ谷氨酰胺）胆汁淤积症存在明显的相关性，肝组织病理表现与BSEP缺陷病例（一种常见的导致低GGT胆汁淤积症的遗传病）极为类似。随后研究者在另一批7例不明原因低GGT胆汁淤积散发病例中找到2例携带MYO5B双突变的病例；并通过后续进行的二代测序，又确认3例MYO5B纯合/复合杂合突变、临床表现为不明原因低GGT胆汁淤积病例。至此，研究者证明MYO5B基因突变是导致低GGT胆汁淤积症的重要遗传病因，可解释大约20%的不明原因低GGT胆汁淤积症。

o      该研究成果揭示了第一个由中国研究人员发现的胆汁淤积症致病基因，并初步阐明了MYO5B缺陷导致胆汁淤积的临床特点、在不明原因低GGT胆汁淤积症中的比例、以及突变严重程度与不同表型的关系，为胆汁淤积症的精确诊断向前推进了一步。

目的区域测序文章

o    家族性高胆固醇血症(FH)是一种罕见的常染色体显性遗传性疾病，其临床特点是低密度脂蛋白（LDL）胆固醇数值异常超高，早发心血管疾病。其主要致病基因有低密度脂蛋白受体（LDLR）、载脂蛋白B100（ApoB）、枯草溶菌素9（PCSK9）

o    本研究共有8050例进行血管造影的中国患者入组，FH诊断标准为荷兰DLCNC诊断标准。基于外显子靶向测序检测了245例可能/明确FH患者。

o    结果表明在所有接受造影检测的患者中，约有3.5%为可能或明确家族性高胆固醇血症患者（1%为明确，2.5%为可能），但无一人LDL-C达标。约46.9%的可能/明确FH患者检测到致病基因的变异。

断裂富集测序文章

o    背景：核糖体RNA的转录是核糖体形成的限速步骤，而核糖体RNA基因所在的位置被认为是人类基因组最脆弱的地方。研究发现核糖体RNA基因的转录调控与DNA双链断裂的热点位置存在紧密关联。叶酸(folate)是人体许多一碳反应所必需的一类微量营养素,含多种还原形式，是一组与 DNA 合成、甲基基团转移相关的重要中间介质，对细胞的分裂和生长以及表观遗传基因表达调控有着重要意义。

o    研究内容：本研究利用叶酸拮抗剂（一种神经管畸形风险因素），探究了小鼠胚胎干细胞（mESCs）在叶酸缺乏状态下的DNA双链断裂图谱

o    主要结果：利用天昊生物的断裂富集二代测序，本研究观察到了叶酸缺乏引起的DNA双链断裂富集在rRNA基因处。此外，叶酸拮抗剂的处理可募集上游结合因子至rRNA基因，促进其转录。

o    结论：本研究提示叶酸在维持基因组稳定性中的重要性，同时展示了在发育早期叶酸水平如何通过表观调控引发DNA断裂，进而调控rRNA基因的转录。该研究为神经管发育畸形提示了新的研究视角。

图：DNA双链断裂富集测序工作流程

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